慶應三年——幕末動亂時代。
由於將軍德川慶喜的大政奉還，江戶幕府瀕臨解體，幕府與討幕派的對立日漸激化。近藤勇、土方歲三率領的新撰組，在經歷油小路事件後遭受重創，即使如此仍然決定向慶喜效忠。
此時，皇帝向薩摩藩、長州藩下達了討幕的密敕，並緊接著頒布了王政復古的大號令。朝廷宣告了德川幕府的終結。對此承諾的慶喜移居大阪，新撰組也再一次以並非“浪士集團”而是“幕臣”的身份備戰，將屯所移至伏見奉行所。
新撰組隊士·市村鐵之助，懷著對從以前開始就關係親密的少女·沙夜的思念，以副長·土方歲三小姓的身份，與身為隊醫的好友山崎烝、兄長辰之助一起，準備共同迎來身為新撰組一員的命運，但……。
期盼成為武士而前往京都的年輕人們，為了能夠衣錦還鄉而向著戰鬥突進。即使最終迎來的會是悲傷的別離……。
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