本作以武藤遊戲所在的DM時代數十年後的童實野市為舞臺這個時代的童實野市被稱為“新童實野市”，是一個根據身份高低分為上層地帶和下層地帶的階級社會，騎乘著摩托型決鬥盤“D輪”進行的“騎乘決鬥（Riding Duel）”十分流行。在新童實野市的下層地帶“衛星（Satellite）”中與同伴們一起生活的不動遊星，被對手——騎乘決鬥的王者傑克·阿特拉斯搶走了自己最重要的卡“星塵龍（Stardust Dragon）”。為了將它奪回，遊星逃出了衛星區，前往城市上層尋找傑克。然而在戰鬥中，意想不到的事情發生了，一條神秘的紅龍突然出現在他和傑克的面前……
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