王冠市是個水與綠茵、古街道與近代建築完美調合的城市。為了觀看正在這裡舉辦的“神奇寶貝足籃世界杯”，小智一行人向王冠市前進。在途中，他們遇到了一隻能夠化身其他神奇寶貝或人類、名為“索羅亞”的不可思議的神奇寶貝。索羅亞還會心電感應，為了幫助同伴，它告訴小智它也要前往王冠市。小智們決定要栛助索羅亞，一起結伴同行。另一方面，幻之寶可夢雪拉比在相隔20年再度現身王冠市的同時，王冠市卻發生了一起奇妙的事件。原本應該是這座城市的守護神－傳說的寶可夢雷公、炎帝、水君竟在街道上大搞破壞。原來這個事件的背後，隠藏著大企業的社長克林克斯·寇泰的邪惡計劃。從前，曾經利用雪拉比的神秘力量獲得財富與權力的寇泰，為了再度取得這個力量，他故意製造王冠市..
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