警察無法完全應對的世界規模治安危機，導致了一種新職業——武偵的出現。武偵，即在法律框架內(不排除少數例外)，解決個人或組織的委托，彌補警察的不足，維護社會和平的武裝偵探。而本故事，就發生在那樣一個時代的武偵培養學園——東京武偵高。一直向往普通人的平靜生活，期望盡快從東京武偵高轉走的少年——遠山金次，有個自初中(神奈川武偵高附屬中學)畢業後一直隱藏的秘密。然而，渴望平靜的他，卻在一場駭人的自行車劫持事件中，邂逅了自此將改變他人生軌跡的人物——神崎·H·亞裡亞。 金次的秘密究竟是什麼？神崎·H·亞裡亞究竟是何方神聖？金次將被這嬌小可愛但性格兇暴的粉發少女帶往何方
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