過去篇共6話，終於迎來了完結——故事發生在宇宙世紀 0079 年 1 月 23 日，吉翁與地球聯邦間一決雌雄的戰爭，終於在 SIDE 5 魯姆爆發。在戰爭中被逼入絕境的吉翁，手中握有秘密武器。就是用人型兵器「MS」所組成的特別突擊大隊，讓戰況一舉逆轉並大獲全勝。當中，隸屬吉翁軍的夏亞・阿茲那布爾，駕駛著「薩克Ⅱ」立下戰積並因此晉升為少校，更獲得「紅色彗星」的別名。而在魯姆會戰後，地球聯邦軍策畫了對抗吉翁軍的＂V 作戰＂。遠在 SIDE 7 的少年阿姆羅・雷，自行動身去找尋新兵器「鋼彈」的秘密。另一方面，在地球的南極大陸，吉翁及地球聯邦兩軍間和平談判的場合，某項聲明卻從月神二號向全世界發出……。
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