這個世界上曾經有著一個被稱為“光之巨人”的存在不久，“光之巨人”完成了他的使命，返回了遙遠宇宙的故鄉，跟他同化的地球人也失去了過往的記憶，回到了自己原本的地方。奧特曼的存在已成為過去之物，科學特搜隊日本支部也結束了它的功能，被改建成光之巨人紀念館。早田進次郎是一名已經過了多愁善感的青春期的高中生。然而，他意識到自己擁有驚人的彈跳力和健壯的肉體等正常人類所不具有的力量。某天，進次郎知道了父親早田進曾經是奧特曼。而且，在沒有奧特曼守護的地球上，暗中策劃各種陰謀活動的外星人依然存在著。作為隱秘組織而健在的科學特搜隊的井手隊員開發了奧特曼裝甲，而進次郎是少數可以穿裝著它的適合者。“開門見山地說吧——我希望你能成為奧特曼！
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