明萬歷年間，朝廷內憂外患不斷，古龍鎮上一家名為飛刀門的武館也由於戰亂而日漸蕭條，師父老李飛刀和兩個關門弟子--萬里風和牛大春，一起過著不問世事的平靜日子。好景不長，老李飛刀的結拜兄弟，起義軍領袖郭靖明將女兒郭盈盈托付給老李飛刀照顧，與此同時老李飛刀青梅竹馬的師妹，已被皇帝選為貴妃的牛婉君，也由於後宮鬥爭，帶女兒芊芊和太監小順子到飛刀門避難。這些人同在一個屋簷下卻有著相反的立場，老李飛刀一邊努力化解雙方的隔閡，一邊又要保護師妹不受皇後爪牙的襲擊，牛貴妃在親歷了老李飛刀為自己所做的一切之後，與昔日的師兄再續前緣。二十年一度的華山論劍，郭靖明與朝廷的夏將軍雙雙前來，意欲借華山論劍之機拉攏武林中人為自己效力，中途卻傳來倭寇入侵的消息，起義軍與朝廷官兵盡棄前嫌，共禦外敵，老李飛刀以盟主的身份組織武林人士協助官軍，朝廷表彰其功績，飛刀門被禦封“武林第一門”。
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