凱撒（安迪·瑟金斯飾）和他的領導的猿族為求生存與人類交戰，在堅守家園的同時也在尋找其它宜居的地方。殘暴的“上校”（伍迪·哈裡森飾）領導的軍隊入侵了凱撒的基地，並殺害了他妻兒在內的眾多猿族子民。這激發了凱撒內心中黑暗的一面，心中燃起復仇的烈火。凱撒讓幸存的猿族啟程去他兒子生前發現的避風港，而自己決意去找“上校”報仇。凱撒不久後發現“上校”不僅對猿族趕盡殺絕，同時也在與另一撥人在交戰。邪惡上校襲擊並囚禁了逃生的猿，迫使他們為自己的根據地築防。時間緊迫，另一支人類軍隊就要兵臨城下，與上校的軍隊交戰；並很有可能危及猿族子民。為了解救自己的子民，凱撒此時強忍著復仇的怒火，策劃並成功實施了逃生計劃。
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