天才科學家惡之宮博士（柄本明飾）在遭到國家的背叛之後，滿懷著仇恨怒火組建了邪惡細胞軍團Σ。他命令爪牙四處抓捕並吸取政要的細胞，以製造足以毀滅世界的恐怖武器。在此期間，於遺傳領域有著卓絕貢獻的大門勇博士（竹中直人飾）拒絕與惡之宮合作而慘遭殺害。大門博士的兒子大門豐（古原靖久飾）與父親開發的電人查勃卡為了正義，與細胞軍展開艱苦卓絕的鬥爭，期間還與本為敵人的博格小姐（山崎真實飾）。但是，他所篤定堅持的正義最終將查勃卡引向滅亡。25年後，潦倒不堪的大門豐（板尾創路飾）委身於無良政客若杉（木下ほうか飾），受盡屈辱，而惡之宮的邪惡計劃則接近完成……
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