在一個晴朗明媚的日子裡，自稱廢柴的學生君逆回十六夜（淺沼晉太郎 配音）、溫柔善良愛護小動物的春日部耀（中島愛 配音）以及高傲自大的大小姐久遠飛鳥（布裡德卡特•塞拉•惠美 配音）各自收到一封邀請函，信中說道：“告知煩惱眾多、擁有異能的少男少女，如果期望一試自己的才能，那麼就拋棄世上的一切，到我等的‘箱庭’來”。原來他們三人均為擁有超能力的問題兒童。似乎接受了邀請，他們被拋入風景秀美的箱庭世界，並遇見說明人黑兔（野水伊織 配音）。十六夜他們得知，必須運用天賜的特異功能在箱庭進行難度不等的神魔遊戲。不按常理出牌的主人公以及藏著無數秘密的箱庭，一切變得好玩起來……本片根據竜ノ湖太郎（文）、天之有（插畫）的原作改編。
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